MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 chromosome

Total Repeats: 52133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015516	AGG	2	6	49	54	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015516	TTCT	2	8	114	121	0 %	75 %	0 %	25 %	332685535
3	NC_015516	ACA	2	6	149	154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685535
4	NC_015516	AAT	2	6	173	178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685535
5	NC_015516	ATT	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685535
6	NC_015516	A	7	7	225	231	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
7	NC_015516	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685535
8	NC_015516	T	7	7	289	295	0 %	100 %	0 %	0 %	332685535
9	NC_015516	TAG	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685535
10	NC_015516	A	6	6	335	340	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
11	NC_015516	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
12	NC_015516	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
13	NC_015516	A	6	6	380	385	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
14	NC_015516	GCT	2	6	455	460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332685535
15	NC_015516	AGA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
16	NC_015516	T	7	7	503	509	0 %	100 %	0 %	0 %	332685535
17	NC_015516	ATGC	2	8	542	549	25 %	25 %	25 %	25 %	332685535
18	NC_015516	CCA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332685535
19	NC_015516	AACC	2	8	572	579	50 %	0 %	0 %	50 %	332685535
20	NC_015516	TAG	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685535
21	NC_015516	TTA	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685535
22	NC_015516	CAAA	2	8	641	648	75 %	0 %	0 %	25 %	332685535
23	NC_015516	A	6	6	646	651	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
24	NC_015516	GAT	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685535
25	NC_015516	AAG	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
26	NC_015516	AGA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
27	NC_015516	T	6	6	746	751	0 %	100 %	0 %	0 %	332685535
28	NC_015516	TA	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	332685535
29	NC_015516	ATA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685535
30	NC_015516	CT	3	6	866	871	0 %	50 %	0 %	50 %	332685535
31	NC_015516	CCA	2	6	884	889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332685535
32	NC_015516	A	7	7	919	925	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
33	NC_015516	GATT	2	8	982	989	25 %	50 %	25 %	0 %	332685535
34	NC_015516	ACA	2	6	1061	1066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685535
35	NC_015516	GCT	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332685535
36	NC_015516	A	6	6	1112	1117	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
37	NC_015516	AAG	3	9	1140	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
38	NC_015516	A	7	7	1189	1195	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
39	NC_015516	TC	4	8	1237	1244	0 %	50 %	0 %	50 %	332685535
40	NC_015516	TGG	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332685535
41	NC_015516	A	6	6	1326	1331	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
42	NC_015516	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	332685535
43	NC_015516	AAG	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685535
44	NC_015516	TTTA	2	8	1468	1475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015516	CTA	2	6	1513	1518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015516	TAT	2	6	1523	1528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015516	TA	6	12	1530	1541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015516	ATT	3	9	1542	1550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015516	AAAG	2	8	1567	1574	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015516	TTC	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332685536
51	NC_015516	ACA	2	6	1657	1662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685536
52	NC_015516	TTTA	2	8	1709	1716	25 %	75 %	0 %	0 %	332685536
53	NC_015516	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685536
54	NC_015516	TTC	2	6	1835	1840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332685536
55	NC_015516	AAT	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685536
56	NC_015516	A	6	6	1974	1979	100 %	0 %	0 %	0 %	332685536
57	NC_015516	TTA	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
58	NC_015516	ATC	2	6	2014	2019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332685536
59	NC_015516	TAT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
60	NC_015516	ATT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
61	NC_015516	GAA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685536
62	NC_015516	TAT	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
63	NC_015516	ATT	2	6	2388	2393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
64	NC_015516	TAT	2	6	2417	2422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
65	NC_015516	GAAG	2	8	2428	2435	50 %	0 %	50 %	0 %	332685536
66	NC_015516	ATA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685536
67	NC_015516	GAA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685536
68	NC_015516	TTA	2	6	2690	2695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685536
69	NC_015516	ATTA	2	8	2717	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015516	TAA	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015516	AG	3	6	2742	2747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015516	TTC	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015516	TC	3	6	2771	2776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015516	TGA	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015516	AATT	2	8	2845	2852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015516	TAA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015516	ATA	2	6	2881	2886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015516	ATT	2	6	2903	2908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015516	A	7	7	2913	2919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015516	TAA	2	6	2920	2925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015516	T	7	7	2952	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015516	T	6	6	2971	2976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015516	TAA	2	6	2984	2989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015516	A	6	6	2988	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015516	A	6	6	3038	3043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015516	TATAA	2	10	3047	3056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015516	A	6	6	3073	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	332685537
88	NC_015516	AAT	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685537
89	NC_015516	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685537
90	NC_015516	GAA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685537
91	NC_015516	T	7	7	3288	3294	0 %	100 %	0 %	0 %	332685537
92	NC_015516	A	7	7	3300	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	332685537
93	NC_015516	TGAA	2	8	3330	3337	50 %	25 %	25 %	0 %	332685537
94	NC_015516	AAC	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015516	T	7	7	3402	3408	0 %	100 %	0 %	0 %	332685538
96	NC_015516	AAAC	2	8	3429	3436	75 %	0 %	0 %	25 %	332685538
97	NC_015516	CGAA	2	8	3479	3486	50 %	0 %	25 %	25 %	332685538
98	NC_015516	GAA	2	6	3594	3599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685538
99	NC_015516	TA	3	6	3641	3646	50 %	50 %	0 %	0 %	332685538
100	NC_015516	TTTG	2	8	3664	3671	0 %	75 %	25 %	0 %	332685538
101	NC_015516	ACC	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332685538
102	NC_015516	TTTA	2	8	3849	3856	25 %	75 %	0 %	0 %	332685538
103	NC_015516	GCA	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332685538
104	NC_015516	TTA	2	6	3918	3923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685538
105	NC_015516	A	7	7	3956	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	332685538
106	NC_015516	AAC	2	6	3978	3983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685538
107	NC_015516	TTACC	2	10	4008	4017	20 %	40 %	0 %	40 %	332685538
108	NC_015516	GAT	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685538
109	NC_015516	AT	3	6	4163	4168	50 %	50 %	0 %	0 %	332685538
110	NC_015516	ACA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685538
111	NC_015516	AAC	2	6	4189	4194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685538
112	NC_015516	GAA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685538
113	NC_015516	GAT	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685538
114	NC_015516	TGA	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685538
115	NC_015516	TTA	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685538
116	NC_015516	T	6	6	4342	4347	0 %	100 %	0 %	0 %	332685538
117	NC_015516	AT	3	6	4398	4403	50 %	50 %	0 %	0 %	332685538
118	NC_015516	AAT	2	6	4420	4425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685538
119	NC_015516	ATGAC	2	10	4439	4448	40 %	20 %	20 %	20 %	332685539
120	NC_015516	AGA	3	9	4449	4457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685539
121	NC_015516	A	7	7	4457	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	332685539
122	NC_015516	GAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685539
123	NC_015516	GTAT	2	8	4547	4554	25 %	50 %	25 %	0 %	332685539
124	NC_015516	CAA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685539
125	NC_015516	TGA	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685539
126	NC_015516	GTT	2	6	4684	4689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685539
127	NC_015516	A	6	6	4724	4729	100 %	0 %	0 %	0 %	332685539
128	NC_015516	GGT	2	6	4774	4779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332685539
129	NC_015516	TGG	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332685539
130	NC_015516	TGG	2	6	4809	4814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332685539
131	NC_015516	TGT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685539
132	NC_015516	TA	3	6	4874	4879	50 %	50 %	0 %	0 %	332685539
133	NC_015516	TAT	2	6	4894	4899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685539
134	NC_015516	TCCAGA	2	12	4983	4994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332685539
135	NC_015516	AATTT	2	10	5015	5024	40 %	60 %	0 %	0 %	332685539
136	NC_015516	AGA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685539
137	NC_015516	ATT	3	9	5123	5131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685539
138	NC_015516	TAT	2	6	5183	5188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332685539
139	NC_015516	TGA	2	6	5190	5195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685539
140	NC_015516	AAC	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332685539
141	NC_015516	ATA	2	6	5291	5296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685539
142	NC_015516	TAAT	2	8	5354	5361	50 %	50 %	0 %	0 %	332685539
143	NC_015516	A	7	7	5370	5376	100 %	0 %	0 %	0 %	332685539
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148	NC_015516	TTG	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685539
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152	NC_015516	TTG	2	6	5744	5749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685539
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181	NC_015516	TCG	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332685541
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183	NC_015516	GATT	2	8	7229	7236	25 %	50 %	25 %	0 %	332685541
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226	NC_015516	TAGTT	2	10	8973	8982	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_015516	AT	3	6	9411	9416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_015516	AATA	2	8	9417	9424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015516	AT	3	6	9440	9445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_015516	AATAA	2	10	9482	9491	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_015516	TAA	2	6	9502	9507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_015516	TAA	3	9	9548	9556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
247	NC_015516	AGT	2	6	9563	9568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_015516	AAT	2	6	10353	10358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685543
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269	NC_015516	TAG	2	6	10406	10411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685543
270	NC_015516	TCT	2	6	10422	10427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332685543
271	NC_015516	ATA	2	6	10459	10464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685543
272	NC_015516	CTA	2	6	10495	10500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332685543
273	NC_015516	GAT	2	6	10515	10520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332685543
274	NC_015516	AGG	2	6	10545	10550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015516	AGA	2	6	10570	10575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685544
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